MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae INV200

Total Repeats: 42773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017593	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017593	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017593	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017593	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017593	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017593	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017593	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	387758385
8	NC_017593	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	387758385
9	NC_017593	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758385
10	NC_017593	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758385
11	NC_017593	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387758385
12	NC_017593	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758385
13	NC_017593	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758385
14	NC_017593	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758385
15	NC_017593	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	387758385
16	NC_017593	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387758385
17	NC_017593	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758385
18	NC_017593	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	387758385
19	NC_017593	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	387758385
20	NC_017593	AT	3	6	731	736	50 %	50 %	0 %	0 %	387758385
21	NC_017593	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758385
22	NC_017593	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758385
23	NC_017593	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	387758385
24	NC_017593	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758385
25	NC_017593	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387758385
26	NC_017593	A	8	8	1184	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	387758385
27	NC_017593	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387758385
28	NC_017593	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387758385
29	NC_017593	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	387758385
30	NC_017593	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	387758385
31	NC_017593	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	387758385
32	NC_017593	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	387758385
33	NC_017593	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	387758385
34	NC_017593	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387758385
35	NC_017593	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017593	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017593	T	6	6	1588	1593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017593	A	6	6	1603	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017593	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017593	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017593	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017593	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387758386
43	NC_017593	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	387758386
44	NC_017593	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758386
45	NC_017593	AG	3	6	1761	1766	50 %	0 %	50 %	0 %	387758386
46	NC_017593	CAA	2	6	1800	1805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387758386
47	NC_017593	A	7	7	1884	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	387758386
48	NC_017593	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387758386
49	NC_017593	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387758386
50	NC_017593	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387758386
51	NC_017593	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758386
52	NC_017593	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	387758386
53	NC_017593	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758386
54	NC_017593	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387758386
55	NC_017593	AG	3	6	2173	2178	50 %	0 %	50 %	0 %	387758386
56	NC_017593	A	6	6	2267	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	387758386
57	NC_017593	A	7	7	2283	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	387758386
58	NC_017593	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758386
59	NC_017593	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758386
60	NC_017593	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758386
61	NC_017593	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387758386
62	NC_017593	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	387758386
63	NC_017593	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758386
64	NC_017593	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	387758386
65	NC_017593	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	387758386
66	NC_017593	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758386
67	NC_017593	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017593	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387758387
69	NC_017593	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	387758387
70	NC_017593	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	387758387
71	NC_017593	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387758387
72	NC_017593	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758387
73	NC_017593	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758387
74	NC_017593	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017593	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017593	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758388
77	NC_017593	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758388
78	NC_017593	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387758388
79	NC_017593	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	387758388
80	NC_017593	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758388
81	NC_017593	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387758388
82	NC_017593	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758388
83	NC_017593	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758388
84	NC_017593	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	387758388
85	NC_017593	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758388
86	NC_017593	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758388
87	NC_017593	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758388
88	NC_017593	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	387758388
89	NC_017593	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	387758388
90	NC_017593	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	387758388
91	NC_017593	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758388
92	NC_017593	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387758388
93	NC_017593	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758388
94	NC_017593	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758388
95	NC_017593	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758388
96	NC_017593	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758388
97	NC_017593	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	387758388
98	NC_017593	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017593	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017593	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	387758389
101	NC_017593	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	387758389
102	NC_017593	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	387758389
103	NC_017593	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758389
104	NC_017593	AC	3	6	4485	4490	50 %	0 %	0 %	50 %	387758389
105	NC_017593	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	387758389
106	NC_017593	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	387758389
107	NC_017593	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758389
108	NC_017593	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758389
109	NC_017593	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758389
110	NC_017593	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758389
111	NC_017593	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758389
112	NC_017593	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387758389
113	NC_017593	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758389
114	NC_017593	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758389
115	NC_017593	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758389
116	NC_017593	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387758390
117	NC_017593	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	387758390
118	NC_017593	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758390
119	NC_017593	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758390
120	NC_017593	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758390
121	NC_017593	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758390
122	NC_017593	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387758390
123	NC_017593	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	387758390
124	NC_017593	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	387758390
125	NC_017593	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758390
126	NC_017593	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	387758390
127	NC_017593	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758390
128	NC_017593	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387758390
129	NC_017593	T	6	6	5523	5528	0 %	100 %	0 %	0 %	387758390
130	NC_017593	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758390
131	NC_017593	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	387758390
132	NC_017593	GA	3	6	5630	5635	50 %	0 %	50 %	0 %	387758390
133	NC_017593	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758390
134	NC_017593	TCA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758390
135	NC_017593	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758390
136	NC_017593	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758390
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138	NC_017593	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	387758390
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410	NC_017593	GGA	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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